Mit LabImage arbeiten molekularbiologisch orientierte Labore weltweit zur
Auswertung von 1D Elektrophorese Gelen. Die neue Version LabImage 1D 2006
basiert auf der Plattform LabImaging.
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Das Hauptmodul für die Bildverarbeitung umfasst eine breite Palette an bewährten Algorithmen und Bildbearbeitungsfunktionen.
Die Algorithmen sind wie folgt:
Statistik/Berechnung
- Objekteigenschaften: Objektabmessungen, Momente, Objektlage, Verteilungen, Winkel, Quantifizierung von Helligkeiten, Volumen, Schwellenwerte, Standardabweichungen, Formfaktoren, Zählfunktionen
Objektseparation
- aus Objektverbünden wie Zellen innerhalb einer Probe
- Vereinzelung und Zählung
Objektfindung
- auf der Basis definierte Eigenschaften, die an die Parameter des Bildes angepasst werden
- auf der Basis von Helligkeit, Lage, Größe, Farbwerten, Verteilung sowie deren Kombination
- Kantendetektion
Barcodes
- 1D und 2D Barcodes
Bildfilter
- Helligkeit, Kontrast, Farbverteilung
- Staub und Kratzer, Skalierung
- Wahl eines Bildausschnittes
- Farbselektion
- Schärfen, Weichzeichner
- Rauschfilter
- Binarisierung
- Automatischer Fokus
- Automatischer Weißabgleich
Visualisierung
- Anzeige des Bildes, Histogramm, 3D Histogramm
- Einstellbare 3D Plots
- Bildnavigator
- Zoomfaktoren
Bildtypen
- Bildtypen 8, 16 bis zu 24 Bit/Farbkanal
- Im- und Export in alle gängigen Formate
Die Palette an Algorithmen wird ständig verbessert und erweitert.
Bildfilter für spezielle Anwendungen fließen ebenfalls in die Plattform
ein.
Ein Set an vordefinierten Algorithmen für die Detektion von 1D
Elektrophorese Gelen ist bereits integriert und steht für weitere
Anwendungen als Zusatzmodul zur Verfügung.
Module
Die Plattform ist so strukturiert, dass je nach Anwendungsfall spezifische Module integriert werden können. Die folgenden Module stehen dazu bereits zur Verfügung:
Hardwareansteuerung
Die Ansteuerung externer Hardware ist ein wichtiges Modul der Plattform. Die
Steuerung ist zweigeteilt umgesetzt. Der erste Teil besteht aus einer
Abstraktionsebene, die die einheitliche Kommunikation zu jeder Art von Hardware
ermöglicht. Der zweite Teil übersetzt die Befehle der ersten Schicht auf die
jeweilige Hardware. Damit ist es möglich, beliebige Hardware mit gleicher
Funktion an die Plattform anzubinden.
Mehr dazu
Bildanalyse
Das Hauptmodul für die Bildverarbeitung umfasst eine breite Palette an
bewährten Algorithmen und Bildbearbeitungsfunktionen.
Fehlermanagement
Keine Software arbeitet fehlerfrei. Probleme, die durch falsche Bedienung oder
Fehler in der Applikation auftreten können, werden an ein zentrales
Fehlermanagement weitergeleitet. Dieses Fehlermanagement analysiert das Problem
und liefert einen Behebungsvorschlag.
Anbindung an Labor IT
Über marktübliche Datenaustauschformate wie ldt oder HL7 können Daten in die
Software importiert und nach der Analyse ebenfalls exportiert werden.
Lizenzmanagement
Der Schutz der Investition in eine Software mit Hilfe eines Lizenzmanagements
ist ein wichtiger Bestandteil der Plattform. Mit Hilfe von Lizenzen kann der
Workflow innerhalb der Software gesteuert werden.
Updateprozesse
Die Weiterentwicklung der Software und der Plattform bedingt die Lieferung von
Updates. Im Rahmen des Updatemoduls können neue Funktionen und
Fehlerbehebungen über das Internet sowie über Datenträger geliefert werden.
Reporting
Um aufwendige Programmabläufe und Analysen der Applikation zu präsentieren und
zu dokumentieren, ist ein Reportgenerator integriert.
Mehrsprachenfähig, OEM fähig
Die Internationalisierung der Plattform und somit auch der darauf basierenden
Applikationen wird durch Sprachdateien sichergestellt.
Nutzung offener Standards
Durch die Nutzung offener Standards wird die Kompatibilität zu anderen
Schnittstellen der Plattform übergreifend sichergestellt.
Anbindung von Datenquellen
Die Plattform verfügt über eine Schnittstelle zu Datenbanken bzw. anderen
externen und internen Datenquellen.
Weitere Funktionen
- Anbindung eines RSS Feeds für Newseinblendung
- Jede Art von Kommunikation zu Webservices, Browserkomponenten
- Integration von Plugins, die für Struktur von Eclipse geschrieben wurden
- Integration von Plugins der IBM (Messaging, Collaboration)
Die Palette an Modulen wird laufend erweitert und komplettiert. Lesen Sie hier, welche Software bereits auf der Plattform basiert.
